根據底部形狀的不同可分為平底和圓底（U型和V 細胞培養板型）平底的什麼類型的細胞都可用﹐但當細胞數目較少﹐如做克隆時﹐就用96孔平底板﹐另外﹐做MTT等實驗時﹐無論貼壁 和懸浮細胞﹐一般均用平底板。至于U或V型板﹐一般在某些特殊要求時才使用。如在免疫學方面﹐當做兩種不同淋巴細胞溷合培養時﹐需要二者相互接觸以刺激﹐ 因此﹐一般需要U型板﹐因細胞會由于重力的作用而聚集在一個很小的范圍內。V型板的用途更少﹐一般用于細胞殺傷實驗時﹐為了使效靶細胞緊密接觸﹐常使用V 型板﹐但這種試驗也可用U型板替代(加入細胞后﹐低速離心) 　如果是養細胞的話， 通常是選用平底的， 另外要特別注意材質，圓底的好像沒聽說過拿來養細胞。 圓底的通常是拿來做分析， 化學反應， 或是保存樣品用的， 因為圓底比較好將液體吸得乾凈，如果用平底的就不好吸了。 不過， 如果你是要測吸光值的話， 一定要買平底的才行。大部分細胞培養都用平底培養板，便于鏡下觀測、有明確的底面積、細胞培養液面高度相對一致，還便于MTT檢測。

圓底培養板主要用于同位素摻入的實驗，需要用細胞收集儀收集細胞的培養。